Lebenswissenschaften - Gruppe Thomas Sokolowski

Thomas Sokolowski

Unsere Forschung zielt darauf ab, biophysikalische Prinzipien und Mechanismen zu ergründen, welche zuverlässige Informationsverarbeitung in biologischen Systemen ermöglichen. Insbesondere erforschen wir biochemische Regulationsnetzwerke welche relevante Informationen im Inneren von biologischen Zellen verarbeiten und zwischen ihnen propagieren. Diese basieren auf genuin stochastischen biochemischen Prozessen, welche mit begrenzten Ressourcen (Anzahl von Regulationsproteinen) auskommen müssen. Zelluläre Informationsverabeitungsprozesse sind daher von Grund auf stark verrauscht und daher auf Mechanismen angewiesen, welche dieses Rauschen kontrollieren. 

Wir kombinieren Methoden aus der statistischen Physik und Computerphysik, der quantitativen Biologie, der Biochemie, der Informationstheorie, und der mathematischen Optimierung. Damit untersuchen wir Systeme, welche sich über mehrere Größenordnungen von räumlichen Skalen erstrecken, von einzelnen bis wenigen biochemischen Molekülen innerhalb einer biologischen Zelle bis hin zu Gewebestrukturen, die aus Tausenden von Zellen bestehen, und Populationen von Organismen.

Fellow Detail

Forschung und Lehre

Mitglieder

Protrait-Dummy

Michael Alexander Ramírez Sierra

Doktorand/in

Neuigkeiten

Programming

Thomas Sokolowski bietet den Online-Kurs "Grundlagen der Datenanalyse und Simulation mit MATLAB" an der Goethe-Universität an. Die Einschreibung endet Anfang November. Näheres dazu auf der Seite "Lehre".

Saarbrücken

Michael Ramírez Sierra und Thomas Sokolowski halten Vorträge auf der "Cell Physics 2021"Konferenz an der Universität des Saarlandes in Saarbrücken.

Taunus

Gemeinsam mit 4 anderen neu gegründeten Forschungsgruppen im Rhein-Main-Gebiet beteiligen wir uns an einem wissenschaftlichen Symposium und einer anschließenden Ganztagswanderung im Taunus.

Michael Ramírez Sierra erhält einen der wenigen begehrten Teilnahmeslots an der diesjährigen (virtuellen) q-bio summer school.

Youtube Tumbnail CMMS

Ein Kurzfilm, der die Forschungsansätze unserer und 3 weiterer am FIAS neu gegründeter Forschungsgruppen erklärt, ist nun publik auf dem FIAS YouTube Channel.

phd student

Wir begrüßen Michael Alexander Ramírez Sierra als ersten Doktoranden in unserer Gruppe. In seinem Projekt wird er mittels ereignisgesteuerter stochastischer Simulationen Mechanismen zur robusten Gewebeentwicklung ergründen.

Wir nehmen Teil an der (virtuellen) "Giersch Summerschool & International Conference on Theoretical and Quantitative Cell Biology" (GSIC 2021) am FIAS.

Neurons

Gemeinsam mit Kollaboranten vom IST Austria publizieren wir eine Studie in Neuron, einer der einflussreichsten Fachzeitschriften der Neurobiologie. In der Publikation formalisieren wir ein breit anwendbares theoretisches Konzept, welches sogenannte "optimization priors" verwendet, um mit Annahmen über die Optimalität biologischer Systeme die statistische Inferenz an ihnen zu verbessern.

Thomas Sokolowski

Thomas Sokolowski wird neuer Gruppenleiter und Fellow am FIAS und dem neu gegründeten "Center for Multiscale Modeling in Life Sciences" (CMMS, Frankfurter Zentrum für Mehrskalen-Modellierung).